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Nome da bolsa de estudos / programa

Modelagem computacional de controle do ângulo de crescimento através das plantas superiores



Descrição Importante
Como parte dos esforços contínuos usando computacional e sistemas de abordagens em biologia do desenvolvimento que estamos buscando nomear um graduado com um fundo matemático / computacional para estudar para um doutorado sobre o controle do ângulo de crescimento de raízes laterais e atirar galhos em plantas superiores. A regulamentação deste aspecto fundamental da forma planta tem sido até agora totalmente misterioso: é um fato menos apreciados que os ângulos em que ramos laterais crescem para fora dos principais eixos de plantas não são aleatórias, mas sim são aspectos altamente determinados de sua indivíduo programas de desenvolvimento. Com efeito, se as plantas forem rodadas verticalmente, muitos órgãos laterais irá rapidamente dobrar de modo a retornar ao seu ângulo inicial de crescimento em relação à gravidade, uma quantidade conhecida como o ponto de ajuste do ângulo gravitrópico (GSA). Enquanto o GSA da raiz e parte aérea principal é tipicamente aproximadamente vertical, os valores GSA de brotos laterais e raízes são na maioria das vezes não-vertical, permitindo que a planta para otimizar a captação de recursos de ambos acima e abaixo do solo. Este regulamento espacial da GSA se manifesta em toda a natureza, na forma de padrões específicos de espécies características de controle GSA, talvez mais visivelmente nos diversos padrões de ramificação das árvores. Este projeto oferece a oportunidade de explorar e compreender esses padrões fascinantes de regulação GSA em toda a natureza dentro de uma estrutura computacional.

O projeto baseia-se em descobertas recentes no laboratório Kepinski, bem como efetuar a resposta gravitrópico básica em plantas (o mecanismo pelo qual todos os órgãos para manter sua GSA), que mostraram que a resposta auxina em um único tipo de células especifica o programa de GSA cada órgão lateral. Este trabalho fornece estrutura conceitual para a compreensão da especificação do GSA em toda as plantas mais altas e um ponto de partida para a geração de modelos computacionais de controle GSA. Os modelos estarão prontamente testáveis ​​em laboratório e campo, permitindo que o aluno se envolver diretamente no processo iterativo de experiência dirigida pelo modelo (em colaboração com os experimentalistas no laboratório de acolhimento) e data-driven modelo requinte. Eles também irá ser construído de modo que a relação entre auxina e arquitetura geral da planta pode ser explorado através de uma diversidade de espécies, permitindo ao aluno a contrastar os modelos mais antigos, descritivos de árvore de ramificação por exemplo, com novos modelos mecanicistas e preditivas desenvolvidas dentro do projeto.

O projeto será supervisionado conjuntamente pelo Dr. Stefan Kepinski (Escola de Biologia) e Prof Netta Cohen (Escola de Informática) em Leeds e em conjunto com colaboradores da Universidade de Calgary. Os potenciais candidatos são incentivados a fazer perguntas informais, contactando Dr. Stefan Kepinski por e-mail: s.kepinski @ leeds.ac.uk ou telefone: +44 113 343 2865


Elegibilidade e outros critérios
(European / UK Estudantes Only)
Este projeto de pesquisa tem financiamento anexado. O financiamento para este projecto está disponível para cidadãos de um número de países europeus (incluindo o Reino Unido). Na maioria dos casos isto irá incluir todos os cidadãos da UE. No entanto financiamento total pode não estar disponível para todos os candidatos e você deve ler o departamento completo e os detalhes do projeto para mais informações.


Prazo de inscrição
* 07 de janeiro de 2013


Informações adicionais, e URL importante
4 anos BBSRC studentship, sob a Biologia DTP White Rose mecanicista.
O candidato receberá honorários e remuneração (c.? 13590 para 2013-14). O PhD começará em outubro de 2013. Os candidatos devem ter, ou estar à espera de receber, um grau Hons 2.1 em um assunto relevante. Candidatos da UE deve ter sido residente no Reino Unido, durante 3 anos, para receber apoio.
Há dois estágios para o processo de candidatura. Por favor, consulte o nosso site para mais informações:
www.fbs.leeds.ac.uk / gradschool / palavras-chave / mnuFindaphd.php


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