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Nom de la bourse / programme

Mines ensemble des données de la séquence du génome pour lutter contre les maladies infectieuses



Description Important
Malgré les efforts pour réduire les maladies infectieuses, ils continuent d'entraîner une morbidité significative, la mortalité et le coût social et économique dans le monde entier. La récente disponibilité rapide et peu coûteuse de séquences génomiques entiers générés à l'aide de plates-formes de séquençage de nouvelle génération permettra à de nouvelles approches de diagnostic et de santé publique pour atténuer contre les épidémies de maladies infectieuses. Plus particulièrement, il sera la disponibilité des génomes de plusieurs souches d'un organisme qui facilitera nouvelle compréhension, plutôt que le «génome unique d'une souche de type 'approche utilisée à ce jour. C'est principalement parce que la combinaison de la diversité génétique des populations naturelles ayant des connaissances de chaque isole source, symptômes de la maladie et le phénotype permettra corrélations biologiquement pertinents à faire.
recherche actuelle à l'Université d'Aberdeen mettra à la disposition des séquences du génome entier de plusieurs milliers de génomes (y compris Campylobacter, E. coli O157 et Listeria) La disponibilité des génomes de plusieurs souches facilitera nouvelle compréhension de la biologie de ces des agents pathogènes. En particulier virulence, évolution, association organisatrice, la structure de la population ..
Le projet exploitera un cadre de calcul pour le stockage, la manipulation et l'analyse des données génomiques. Le travail sera en corrélation l'information génétique avec les données épidémiologiques (par exemple, la gravité de la maladie, hôte réservoir, etc) pour améliorer la compréhension de la transmission et de la gravité de ces maladies.
Le candidat retenu aura un premier ou second degré supérieur de classe (ou l'équivalent) soit en mathématiques, physique, informatique, statistique, bioinformatique ou biologie.Connaissance des méthodes mathématiques et statistiques dans un environnement de programmation et bases de données serait avantageux. Cependant la connaissance des bases de données ne soit pas essentiel.
Le superviseur Othe sur ce projet est le Dr Kenneth Forbes, École de médecine et de dentisterie, Université d'Aberdeen.


Admissibilité et autres critères
Si vous avez les qualifications correctes et l'accès à votre propre financement, soit à partir de votre pays d'origine ou vos propres finances, votre demande de travailler avec ce superviseur sera considéré.


Date limite d'inscription
* Les demandes sont acceptées toute l'année


Informations complémentaires et l'URL importante
Les demandes peuvent être acceptées par les étudiants dans le monde entier. Les candidats sont priés de noter qu'il n'y a pas de financement attaché à ce projet donc le candidat retenu devra entièrement responsable pour le paiement des frais de scolarité, frais de subsistance et d'autres coûts associés à ces vivre et étudier à Aberdeen.
Le projet sera attribué à la première requérante approprié. La date de début sera convenu entre le candidat et leurs superviseurs.


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