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Nom de la bourse / programme

La modélisation informatique de commande de l'angle de croissance pour les plantes supérieures



Description Important
Dans le cadre des efforts en cours à l'aide de calcul et des systèmes approches en biologie du développement, nous cherchons à nommer un diplômé avec un fond mathématique / informatique à l'étude pour un doctorat sur le contrôle de l'angle de la croissance des racines latérales et tirer branches chez les plantes supérieures. Le règlement de cet aspect fondamental de la forme de la plante a été jusqu'à présent totalement mystérieux: c'est un fait de sous-estimé que les angles de branches latérales poussent à partir de l'axe de plantes principales ne sont pas aléatoires, mais plutôt des aspects très déterminés de leur personne programmes de développement. En effet, si les plantes sont mises en rotation verticalement, plusieurs organes latéraux se plier rapidement de façon à revenir à leur angle initial de la croissance par rapport à la gravité, une quantité connue comme étant l'angle de consigne gravitropique (GSA). Alors que le GSA de la racine primaire et pousse est généralement sensiblement vertical, les valeurs de la GSA de pousses latérales et les racines sont le plus souvent non verticale, permettant à la plante d'optimiser la capture des ressources à la fois au-dessus et sous-sol. Cette régulation spatiale de GSA est manifeste dans la nature sous la forme de motifs caractéristiques spécifiques à l'espèce de contrôle GSA, peut-être plus visible dans les motifs de ramification diverses d'arbres. Ce projet offre la possibilité d'explorer et de comprendre ces modèles fascinants de la réglementation GSA dans la nature dans un cadre de calcul.

Le projet s'appuie sur les découvertes récentes dans le laboratoire Kepinski, ainsi que d'effectuer la réponse gravitropique de base dans les usines (le mécanisme par lequel tous les organes de maintenir leur GSA), nous avons montré que la réponse de l'auxine dans un seul type de cellule indique le programme de la GSA chaque organe latéral. Ce travail fournit un cadre conceptuel pour comprendre la spécification de GSA à travers les plantes supérieures et un point de départ pour la génération de modèles informatiques de contrôle GSA. Les modèles seront facilement vérifiable en laboratoire et sur le terrain, permettant à l'étudiant de s'engager directement dans le processus itératif de l'expérience de modèle-dirigé (en collaboration avec les expérimentateurs du laboratoire d'accueil) et le modèle de raffinement guidée par les données. Ils seront également construits de sorte que la relation entre l'auxine et de l'architecture globale de l'usine peut être exploré à travers une diversité d'espèces, ce qui permet à l'étudiant de contraste plus âgés, les modèles descriptifs de l'arbre de branchement, par exemple, avec de nouveaux modèles mécanistes et prédictifs développés au sein du projet.

Le projet sera supervisé conjointement par le Dr Stefan Kepinski (Ecole de biologie) et Prof Netta Cohen (école d'informatique) à Leeds et en liaison avec les collaborateurs de l'Université de Calgary. Les candidats potentiels sont encouragés à effectuer des vérifications informelles en contactant le Dr Stefan Kepinski par email: s.kepinski @ leeds.ac.uk ou par téléphone: +44 113 343 2865


Admissibilité et autres critères
(Européenne / Royaume-Uni étudiants seulement)
Ce projet de recherche a fixé le financement. Le financement de ce projet est disponible pour les citoyens d'un certain nombre de pays européens (dont le Royaume-Uni). Dans la plupart des cas, cela comprend tous les ressortissants de l'UE. Financement intégral ne peut pas être disponible pour tous les candidats et vous devriez lire le département complet et les détails du projet pour de plus amples informations.


Date limite d'inscription
* 07 Janvier 2013


Informations complémentaires et l'URL importante
4 années BBSRC bourse d'études, sous la biologie DTP White Rose mécaniste.
Le candidat recevra une rémunération et allocation (c.? 13590 pour 2013-14). La thèse débutera en octobre 2013. Les candidats doivent avoir, ou être s'attendant à recevoir un diplôme avec mention 2.1 dans une discipline pertinente. Candidats à l'UE doivent avoir résidé au Royaume-Uni pour 3 ans afin de bénéficier du plein appui.
Il ya deux étapes dans le processus de l'application. S'il vous plaît consulter notre site Web pour plus d'informations:
www.fbs.leeds.ac.uk / gradschool / mots clés / mnuFindaphd.php


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